Pembentukan Laboratorium Manajemen Data Badan Litbang Kesehatan memiliki tujuan UMUM untuk melakukan pengelolaan dan layanan data hasil penelitian kesehatan yang dilaksanakan oleh Badan Litbang Kesehatan secara Nasional, satuan kerja, ataupun oleh perorangan di lingkungan Badan Litbang Kesehatan dengan sistem yang baik.

     Sedangkan tujuan secara KHUSUS adalah:

1. Melakukan proses manajemen data untuk penelitian kesehatan berskala nasional
2. Melakukan analisis data untuk penelitian kesehatan berskala nasional
3. Melakukan kompilasi data-data hasil penelitian yang dilaksanakan perorangan atau satker di Badan Penelitian dan Pengembangan Kesehatan 
4. Melakukan pelayanan data-data penelitian yang dihasilkan Badan Penelitian dan Kesehatan Kementerian Kesehatan
5. Melakukan penyajian hasil penelitian Badan Penelitian  dan Pengembangan Kesehatan melalui media elektronik